O seu primeiro treino no elenco profissional do Fortaleza aconteceu por acaso. Chamado às pressas para completar o time reserva no coletivo, Erandir impressionou o experiente técnico Ferdinando Teixeira, então treinador do Fortaleza. Com apenas 18 anos, o jovem volante já esbanjava qualidade técnica, além de muita personalidade.

Ferdinando logo pediu para o clube assinar contrato com o jogador, agregando-o ao elenco profissional imediatamente. Em 2000, ele entrou em algumas partidas, sempre como volante e provou que tinha futuro.

Com a saída do zagueiro Augusto, o então presidente do clube, Jorge Mota, solicitou a Ferdinando Teixeira uma indicação para substituir o jogador na temporada 2001. Ferdinando disse que não havia a necessidade, pois o jogador estava em casa: Erandir.

Utilizado como zagueiro pela direita no esquema 3-5-2, Erandir encheu os olhos dos torcedores do Fortaleza com exibições acima da média. Além de defender e marcar bem, constantemente se notava a presença dele no ataque, armando jogadas, servindo os companheiros e de vez em quando marcando gols.

Nas duas últimas temporadas, o jogador atuou como volante e manteve a mesma regularidade. Em 2005, com maturidade, assumiu a faixa de capitão da equipe, passando a ser um líder dentro de campo.

Foi campeão cearense em 2000, 2001, 2003, 2004 e 2005 e duas vezes vice-campeão brasileiro da Série B, em 2002 e 2004.

Ao todo, Erandir fez 295 jogos com a camisa do Leão.